امامزاده خدیجه خاتون بنای آرامگاهی است که بر روی مزار بی بی خدیجه از فرزندان امام موسی بن جعفر بنا گردیده و قدمت آن به دوران قاجار باز می گردد. این بنا در جنوب بافت تاریخی مهرجرد و در کنار قبرستان و مدرسه تاریخی آن قرار داشته و ساختار آن از یک گنبدخانه مرکزی با صحن و ایوان و ورودی (شمالی) و یک دور رواق در سه راستای دیگر (شرق وغرب و جنوب ) اجرا گردیده است. مصالح عمده مصرفی این بنا خشت بوده و تزئینات لایه های داخلی آن با اندود گچ اجرا شده است . امام زاده خدیجه خاتون (س): این امام زاده که در فهرست آثار ملی به ثبت رسیده است همواکنون در مرکز شهرستان میبد در تقاطع خیابانهای طالقانی و شهید وحیدی واقع در محله مهرجرد می باشد. سنگهای موجود در این آرامگاه وجود این بنا را در قرن ششم و هشتم هجری تایید می نماید. عامه مردم اشتباهاً شخصیت مدفون در این مزار را به فرزند امام هفتم (ع) و خواهر امام رضا(ع) نسبت می دهند لیکن حسب اشارت علمای انساب این مرحومه را منتسب به امام جعفرصادق (ع) می دانند که وی خواهر امام زاده جعفر(ع) مدفون در شهر یزد معرفی نموده اند و ظاهراً در نیمه دوم قرن پنجم وفات نموده است.