مسجد جامع خمین با معماری متعلق به دوره قاجاریه و مساحتی 3 هزار مترمربعی در انتهای بازار خمین یکی از آثار تاریخی این شهره که به ثبت ملی رسیده. این مسجد در معماری از دو سبک قدیم و جدید بهره برده، معماری قدیمی مسجد در سمت غرب و معماری جدید در سمت شرقشه. بافت معماری قسمت قدیمی مسجد بیش از یک متر، درعمق زمین احداث شده. کل سقف هاش توسط آجرهای پخته به رنگ قرمز ونخودی در قالب طاق بر روی ستون های قطور آجری ساخته شده. بافت کالبدی این مسجد طوری طراحی شده که در زمستان هوای داخلش گرم و در تابستان خنکه. دیگر ویژگی این مسجد شبستانشه که 22 ستون در کناره ها و 18 ستون در وسط مسجد و طاق ضربی شکل در هفت ردیف قرار داره و مساحتش 400 متر مربعه. برای ورود به این مسجد باید چند پله رو به سمت پایین طی کرد و بعد وارد محوطه داخلی مسجد شد. این اثر در تاریخ 9 فروردین 1378 با شمارهٔ ثبت 2295 به عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده.