بیمارستان امام خلخال دارای بیمارستان دارای 96 تخت بستری مصوب و دارای 6 تخت ICU و 6 تخت CCU و دارای بخشهای داخلی- اطفال- جراحی- زنان- دیالیز - اورژانس- نوزادان- اطاق عمل - زایمان - CT SCAN , رادیولوژی و آزمایشگاه می باشد. درمانگاههای تخصصی ارتوپدی - بیهوشی - گوش، حلق و بینی - اطفال - زنان - مامایی - نورولوژی داخلی - جراحی - قلب - چشم - پوست - اعصاب و روان - مغز و اعصاب - بیماریهای عفونی نیز در این بیمارستان فعال هستند.