موزه باستان شناسی مقدونیه، یکی از قدیمی ترین موزه های کشور است. این موزه را در سال 1924 افتتاح کردند و آن تاریخ به عنوان تاریخ تاسیس موزه ملی در نظر گرفته شده. این موزه در بازار قدیمی و در نزدیکی قلعه اسکوپیه واقع شده است. 10،000 متر مربع مساحت دارد که 6000 متر مربع از آن برای نمایشگاه های دائمی یا موقتی استفاده می شود.