بیمارستان شهید صدوقی یزد در شهر یزد واقع شده است. این مجتمع بزرگترین مرکز آموزشی درمانی جنوب شرق کشور مزین به نام سومین شهید محراب آیت الله صدوقی (ره) هست. بیمارستان شهید صدوقی یزد با زیر بنای 43000 متر مربع در زمینی به وسعت 50 هکتار در قسمت جنوب شرقی شهرستان یزد، در محیطی دور از هیاهوی شهری و در محدوده ای ساکت و آرام بنا گردید. کار طراحی و نقشه برداری بیمارستان از سال 1362 آغاز و در سال 1364 عملیات ساختمانی شروع و در سال 1379 پایان پذیرفت و نهایتا هم در سال 1380 به بهره برداری رسید.
این بیمارستان با بهره گیری از استانداردهای ساخت و ساز بیمارستانی و نیز تلفیقی از ذوق و هنر معماری ایرانی متناسب با شرایط اقلیمی و آب و هوای کویری یزد در پنج طبقه احداث گردیده است. این مرکز درمانی بزرگترین بیمارستان جنوب شرق کشور بوده که روزانه بطور متوسط تعداد 440 بیمار در حال بستری دارد. هم اکنون تعداد 120 عضو هیئت علمی دانشگاه متبوع در این بیمارستان مشغول ارائه خمات درمانی بوده که از این تعداد 60 نفر از اعضای هیئت علمی تمام وقت هستند. این بیمارستان دارای بیست و نه بخش است که 20 بخش بستری و 9 بخش پاراکلینیک هست.