یکی از بناهای قدیمی و با ارزش جمهوری خود مختار نخجوان « مسجد جامع » شهر نخجوانه. این مسجد توسط" حسین تبریزی" در قرون 19-18 احداث شده و مدتهای طولانی محل عبادت مومنین نخجوانی بوده. این عبادتگاه برای آخرین بار 114 سال قبل در سال 1894 از طرف "حاج محمد جعفر آقا" تعمیر و بازسازی شده . اما در این مسجد در

یکی از مهم ترین و بهترین اماکن دیدنی نخجوان، قلعه خان می باشد که هم از نظر معماری ساختمانی بی نیر بوده و کنده کاری ها، آینه کاری ها و نقاشی های زیبایی دارد و هم تبدیل به موزه شده و در فهرست میراث فرهنگی یونسکو نیز به ثبت رسیده است. این مکان دیدنی در حاشیه نخجوان قرار گرفته و در بخش مرکزی نیست.

این موزه در سال 1924 افتتاح شده و موزه تاریخ و مردم شناسی نام گرفته و بعدا به موزه تاریخ و کشور شناسی تغییر نام داده. این موزه، حدود 50 سال از تاریخ نخجوان را برای بازدید کنندگان به نمایش می گذارد و اشیای قدیمی، از جمله سکه ها، سفال ها و ابزارآلات قدیمی در آن نگه داری می شود.

در نخجوان موزه های زیادی وجود دارد. یکی از این موزه ها، موزه ادبیات است که به یاد نظامی گنجوی، شاعر معروف ایرانی ساخته شده و آثار ادبی، مجسمه ها و دیگر موارد مربوط به او را به نمایش می گذارد.