منطقه حفاظت شده مراکان تحت مدیریت اداره کل حفاظت محیط زیست استان آذربایجان غربی قرار دارد. این منطقه براساس اعلام روزنامه رسمی کشور و طبق مصوبه شماره یک شورای عالی شکاربانی و نظارت بر صید به عنوان منطقه حفاظت شده به تصویب رسید. از نظر تقسیمات سیاسی، بخش هایی از منطقه حفاظت شده مراکان در استان آذربای