این مسجد که در قرن 8 هجری و به دست معین الدین اشرف ساخته شد، تا همین چند سال پیش زیر شنها مدفون بود و در سال 1370 بطور اتفاقی کشف شد. بعد از جستجوها و مرمتهایی هم که انجام شد، یک محراب کاشی شده را در قسمت جنوب پیدا کردند. سه سید بزرگوار به نامهای سید رکن الدین، سید کمال الدین و بی بی فضه اینجا دفن ش
مسجد حاجی رجب علی اشکذر مربوط به دوره قاجار است و در اشکذر، محله توده واقع شد. این اثر در تاریخ 5 آذر 1379 با شماره 2896 به عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسید. این اثر تاریخی از 2 قسمت سردخانه و گرم خانه تشکیل شده است. در داخل محراب صحن تابستانی مسجد سنگ مرمری به اندازه 130–80 نصب بوده که میان
حسینیه سفید با قدمت قجری خود در محله توده اشکذر کنار مجموعه تاریخی آسیاب و مسجد حاج رجبعلی اشکذر قرار گرفته و نزد مردم اشکذر بسیار مجرب و سمبل مراسم عزاداری حسینی هست. به گفته اهالی اشکذر، محل این حسینیه قبلا باغی کوچک ولی مالامال از انار خوش آب و رنگ بوده که صاحب آن با دیدن خوابی منقلب شده و آن را