یکی از مهم ترین اماکن دیدنی نخجوان، همین غار می باشد که عده ای معتقدند که همان غاری است که اصحاب کهف، 309 سال در انجا خوابیدند. این غار در 18 کیلومتری مرکز شهر قرار گرفته و در ابتدای جاده، یادمانی از سیمان سفید با پایه های صورتی قرار گرفته که به زبان روسی بر روی آن نوشته شده: غار اصحاب کهف.
شاهکار معماری قرون وسطی، نامی است که محققان به این مقبره هشت ضلعی داده اند. این بنای آجری شش متری، حکم آرامگاه را دارد و با کاشی های فیروزه ای و خط کوفی تزیین شده است. قدمت این مقبره به قرن دوازدهم میلادی باز می گردد و تصویرش بر روی اسکناس های آذربایجانی موجود است.
یکی از مهم ترین و بهترین اماکن دیدنی نخجوان، قلعه خان می باشد که هم از نظر معماری ساختمانی بی نیر بوده و کنده کاری ها، آینه کاری ها و نقاشی های زیبایی دارد و هم تبدیل به موزه شده و در فهرست میراث فرهنگی یونسکو نیز به ثبت رسیده است. این مکان دیدنی در حاشیه نخجوان قرار گرفته و در بخش مرکزی نیست.
این موزه در سال 1924 افتتاح شده و موزه تاریخ و مردم شناسی نام گرفته و بعدا به موزه تاریخ و کشور شناسی تغییر نام داده. این موزه، حدود 50 سال از تاریخ نخجوان را برای بازدید کنندگان به نمایش می گذارد و اشیای قدیمی، از جمله سکه ها، سفال ها و ابزارآلات قدیمی در آن نگه داری می شود.
این مرکز خرید دو طبقه، اجناس مختلف آذربایجانی، روسی، ترکیه ای و آلمانی را در فروشگاه هایش به فروش می رساند. انواع سوغاتی های نخجوان را از خوراکی گرفته تا صنایع دستی، از این مرکز خرید می توان تهیه کرد.
در نخجوان موزه های زیادی وجود دارد. یکی از این موزه ها، موزه ادبیات است که به یاد نظامی گنجوی، شاعر معروف ایرانی ساخته شده و آثار ادبی، مجسمه ها و دیگر موارد مربوط به او را به نمایش می گذارد.