سان خوآن پایتخت و بزرگ ترین شهر کشور پورتوریکوو در شمال شرق آن است. جمعیت این شهر در سال 2010، 395326 نفر بوده است. این شهر بین سال 1508 تا 1521 توسط مستعمره نشینان اسپانیایی بنا شد و در ابتدا شهر پورتو ریکو (Ciudad de Puerto Rico) به معنی "شهر بندر ثروتمند" نام داشت. این شهر از مهم ترین بندرهای کار