کلیسای ملهذان مربوط به دوره صفوی است و در شهرستان خوی، روستای ملهذان واقع شده و این اثر در تاریخ 2 شهریور 1378 با شمارهٔ ثبت 2389 به عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده است.